Cygwinの表示フォント変更方法をまとめておきますので、日本語が正常に表示できない場合などに参考にしてください。
まず、Cygwinターミナルを立ち上げます。次にタイトルバーを右クリックし、[Options]をクリックします。
設定ダイアログでTextを選び、表示に使いたいフォントをFontに指定します。 日本語を表示する場合は例えば、
Font : MSゴシック Locale : ja_JP Character Set :UTF-8
とすればいいと思います。
文字化けしてしまったりしたときに試してみてください。